De Stichting Vliegend Museum Seppe is een Algemeen Nut Beogende Instelling (ANBI), geregistreerd onder nummer 8074.45.897.
De ANBI-status maakt het mogelijk als schenker gebruik te maken van de belastingvoordelen van de Geefwet. De status geeft het museum ook verplichtingen om transparant voor schenkers te werk te gaan. Daarom publiceert de Stichting Vliegend Museum Seppe haar ANBI jaarverslag.
Het beleidsplan en veiligheidsplan liggen ter inzage bij de receptie van het museum alsook het secretariaat.